El Dr. Saotome regresa de entre los muertos después de haber sido aparentemente asesinado por el piloto de Getter, Nagare Ryoma, y ​​amenaza al mundo con su última creación: el Shin Dragon. Ryoma se une a regañadientes con sus antiguos copilotos Jin Hayato y Tomoe Mushashi para combatir al Dr. Saotome. Los pilotos también deben lidiar con los misteriosos invasores, extraterrestres que tienen la capacidad de poseer humanos y deformar su carne para formar criaturas horribles.